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  • 中药基因组文章集/多组学联合分析本草基因组学( herbgenom- ics) 的研究范畴、研究思路、具体研究内容
    中药基因组文章集/多组学联合分析...
    发布日期:2022-05-20 浏览次数:14
    中药基因组文章集/多组学联合分析本草基因组学( herbgenom- ics) 的研究范畴、研究思路、具体研究内容        2000 年提出了中药基因组学( TCM genom- ics) 的概念,即以药物基因组( pharmacogenomics) 理论为基 础,将中药的药性、功能及主治与其在人体内代谢/疾病相关 基因表达调控相关联,在分子水平研究中药在人体基因组介 导下的代谢转化、作用靶点、毒副反应、药效机制和中药整体化作用的规律。中药基因组学的核心内容是应用基因组信 息和方法在人类基因组水平研究中药体内代谢和反应的遗 传学本质。中药基因组学的理解,则...
  • 生信云工具—热图绘制
    生信云工具—热图绘制
    发布日期:2022-05-11 浏览次数:61
    生信云工具—热图绘制        在组学研究中,我们常常会用到热图(Heatmap)。色彩丰富的热图总能吸引读者的眼球,给文章增色。但想一款能调整不同参数的热图绘制工具,大部分还是要收费,今天我们就解释一款免费云工具,能快速且展示多样的热图。接下来就教大家用一个带有表头的以tab分隔的表格数据绘制一个热图。 1.  数据准备 输入文件格式:        矩阵文件:文件为二维矩阵文件,第一行一般为样本,第一列为基因名 ...
  • 数据上传|全基因组DNA甲基化原始数据
    数据上传|全基因组DNA甲基化原...
    发布日期:2022-05-06 浏览次数:103
    数据上传|全基因组DNA甲基化原始数据        全基因组DNA甲基化测序(WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。 下面分享一下全基因组甲基化原始数据在SRA(https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/)的上传方法。 一、准备工作 1、NCBI账号注册(此处不再介绍,具体方法见公众号“数据上传|微生物16S...

中药基因组文章集/多组学联合分析本草基因组学( herbgenom- ics) 的研究范畴、研究思路2022-05-20

中药基因组文章集/多组学联合分析本草基因组学( herbgenom- ics) 的研究范畴、研究思路、具体研究内容        ...

大豆线粒体基因组揭示细胞间和系统发育水平的复杂基因组结构和基因进化2022-05-12

确定线粒体基因组对于阐明种子植物的重要活动很重要。线粒体基因组对每个植物物种都是特定的,因为它们在进化过程中具有可变的大小、复杂的结构和基因丢失和增益的模式。与核和叶绿体基因组相比,这种复杂性使...

线粒体DNA:被忽视的癌基因组?2022-05-12

受扰动的线粒体生物能量学构成了癌症相关代谢功能障碍的核心支柱。虽然癌症中的线粒体功能障碍可能是由无数生化原因引起的,但历史上被忽视的来源是线粒体基因组。最近的大规模测序工作和临床研究强调了人类肿...

生信云工具—热图绘制2022-05-11

生信云工具—热图绘制        在组学研究中,我们常常会用到热图(Heatmap)。色彩丰富的热图总能吸引读者的眼球,给文...

数据上传|全基因组DNA甲基化原始数据2022-05-06

数据上传|全基因组DNA甲基化原始数据        全基因组DNA甲基化测序(WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平...

叶绿体基因组的比较分析揭示了药用植物冬凌草的系统发育关系和种内变异2022-04-28

冬凌草(Hemsley) H. Hara (唇形科) 是一种传统的中药植物,已被用于治疗各种人类疾病和病症,如炎症、呼吸道和胃肠道细菌感染以及恶性肿瘤。然而, I的主要活性成分的含量。不同产地的...

KASP 是如何工作的2022-04-28

KASP 基因分型反应包括三个部分: 1.带有感兴趣序列的 DNA 样本 2.KASP Assay Mix  (包含目标特异性引物) 3.KASP-...

中国贝母的基因条带和系统进化分析2022-04-27

中国贝母的基因条带和系统进化分析        本文是Qi Chen , Haisu Hu and Dequan ...

“真香”技术之—利用流式细胞术鉴定基因组大小和染色体倍性2022-04-25

“真香”技术之—利用流式细胞术鉴定基因组大小和染色体倍性        流式细胞术(Flow cytometer,FCM)是20...

高分辨率的时间动态转录组学揭示Gh-CAL介导的棉花开花调控通路2022-04-24

高分辨率的时间动态转录组学揭示Gh-CAL介导的棉花开花调控通路 一区,影响因子:9.803         &nb...

关于植物线粒体酶活性测定2022-04-23

什么是植物酶活性? 酶活性通常是植物中生长虫子的目标。酶是生物催化剂。就像其他催化剂一样,它们会降低活化能,从而使反应以所需的方向进行。线粒体是呼吸作用的场所,通过氧化磷酸化产生化学...

牵牛花中细胞器基因组变异揭示寄生植物的独立进化场景和植物线粒体复合体的多样性2022-04-23

本文是2022年3月浙江西湖高等研究院发表在《BMC Biology》(IF:7.431)题为“Unprecedented organelle genomic variations in m...

适当的人为干预促进了长期风化的铝土矿残渣弃置区微生物群落的发展和土壤形成2022-04-22

适当的人为干预促进了长期风化的铝土矿残渣弃置区微生物群落的发展和土壤形成 文章简介 期刊:Journal of Hazardous Materials ...

线粒体基因组——线粒体表型表达的不同水平2022-04-21

自然选择作用于表型。因此,许多人错误地期望仅在有机体中观察其特征,而忽略了其对组织、细胞和亚细胞区室的影响。这在线粒体基因组 (mtDNA) 的情况下尤为重要,与细胞核不同,线粒体基因组存在于多...

有机化合物中元素的检测2022-04-21

检测有机化合物中存在的元素是其分析的重要步骤。所有的有机化合物都含有碳。大多数有机化合物中也存在氢(少数例外是化合物,例如 CCl 4、CS 2等)。除了碳和氢之外,通常存在于有机化合物中的其他...