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常规非靶标代谢组学

发布日期:2019-03-06 浏览次数:343

  • 产品简介
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  • 案例分析
  • 常见问题

  非靶向代谢组学主要是将对照组和实验组的代谢物(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。其分析一般包括:

  代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物。

  代谢物鉴定:进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构。

  代谢物注释:研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。


  LC-MS代谢组

  产品定义

  通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化,进而阐明生物体代谢相关过程的代谢组学技术。其研究对象主要是相对分子质量1000以下的内源性小分子代谢物。


  技术原理

  液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物,因此LC-MS可以分析的化合物种类范围比GC-MC广。LC-MS适合作为未知代谢物研究中的探索方法,或者在多种目标代谢物由于挥发性问题不能用GC-MS进行分析时采用。


  实验流程


  使用仪器

  agilent UHPLC1290-Agilent6550; agilent UHPLC1290-AB6600


  质谱分析模式

  正离子模式             负离子模式


  技术优势

  相对于NMR,重复性和灵敏度更高

  相比于GC-MS,分析范围更广


  应用领域

  表型和生理功能研究                                 疾病病理研究                           临床诊断及治疗

  药物研究


  1、代谢组学研究基因型和农艺条件对所选的草莓栽培品种的影响

  本研究以三个不同敏感程度的草莓栽培品种在三种不同的基质下进行代谢组测序。本研究为不同品种或不同农艺/环境胁迫条件下产生的耐受机制相关的标志化合物的鉴定提供了思路。




  2、血清和肌肉代谢组学用于预测PH,鸡肉质量的关键指标

  本研究通过对20个高pHu(pHu +)和19个低pHu(pHu-)两个雄性肉鸡遗传系的胸大肌和血液样本进行代谢组测序,采用多模块OPLS-DA模型去除不相关因素从而鉴定与pHu相关的代谢物。


血清和肌肉NMR的拟合多模块OPLS-DA分析


  参考文献:

  1. Akhatou I, González-Domínguez R, Fernández-Recamales á. Investigation of the effect of genotype and agronomic conditions on metabolomic profiles of selected strawberry cultivars with different sensitivity to environmental stress[J]. Plant Physiology and Biochemistry, 2016, 101: 14-22.